Bayrou também foi acusado por um ex-gendarme de "intervir" no caso de um clérigo acusado de violação em 1998, que se suicidou em Roma dois anos depois.

Cerca de 200 ex-alunos de Bétharram relataram que sofreram agressões físicas e sexuais quando frequentavam a escola. Bayrou nega que tivesse conhecimento dos factos à época. Os filhos do Primeiro-Ministro estudaram nessa escola, onde a sua mulher deu  catequese.

Hélène Perlant, filha de Bayrou, revelou à revista Paris Match que foi vítima de agressões quando tinha 14 anos, e que não comentou nada com seu pai à época dos factos. "Assim como os outros pais, estava muito envolvido politicamente, a nível local [...] Quanto mais envolvido se está, menos se vê, menos se entende. Quanto mais testemunhas há, menos se fala", disse Hélène, 53.

Os factos denunciados pela filha de Bayrou ocorreram durante um acampamento de verão. "Éramos cerca de 40, incluindo os monitores. Certa noite, enquanto preparávamos os sacos de dormir, o padre Lartiguet agarrou-me de repente pelos cabelos e arrastou-me vários metros no chão, dando-me socos e pontapés em todo o corpo, principalmente no estômago", resumiu.